先天性无阴道目前无法有效预防，但可通过科学用药、避免接触放射线、定期体检等方式避免下一代患病以及尽早发现异常。
1、科学用药
妊娠期间，孕妇不可自行用药，若由于疾病需要，应在医生建议下服用，以防影响胎儿发育。
2、避免接触放射线
妊娠期的孕妇避免接触放射线，不可频繁进行X线、CT等检查，以防导致胎儿发育畸形。
3、定期体检
胎儿出生后需定期体检，青春期注意观察第二性征发育情况及有无月经来潮，及时发现发育异常。
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