滤泡性结膜炎患者可通过一般治疗、药物治疗、并发症治疗等方法治疗，具体分析如下：
1、一般治疗
建议患者及时清理眼部分泌物，保持眼部清洁，养成良好的用眼习惯，保持充足的睡眠时间，避免过度用眼，以免造成病情加重。
2、药物治疗
患者可遵医嘱应用四环素可的松眼膏、妥布霉素地塞米松滴眼液、氟米龙滴眼液等激素类药物治疗，控制炎症发展，促进病情恢复。
3、并发症治疗
如果引起角膜瘢痕，并且累及深基质层或基质层，患者可遵医嘱通过角膜移植手术的方法治疗，改善角膜状态，控制病情发展。
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