新生儿泌尿系统感染的治疗方法有一般治疗、药物治疗、手术治疗等。
1.一般治疗
平时应该及时更换尿布，清洗外阴，保证局部清洁、卫生，尽量不要穿开裆裤，以免病原菌再次侵犯。
2.药物治疗
应在医生的指导下给新生儿使用注射用头孢曲松钠、注射用哌拉西林钠舒巴坦钠等药物，阻碍细菌细胞壁的合成，促进炎症消退。
3.手术治疗
可以进行经皮肾造瘘术，改善尿路畸形、尿路梗阻等原因引起的排尿异常，促进正常排尿，减少细菌的繁殖。
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