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胃食管反流的辅助检查有很多，需要根据胃食管反流的不同方面，使用不同的辅助检查手段。包括胃镜、24小时反流监测、食管压力检查、动力检查和上消化道造影。
胃镜是胃食管反流最基本的检查，通过胃镜可以看到反流引起的食管炎、巴雷特食管、食管狭窄，通过胃镜还可以评估贲门部位的形态，以及松弛的程度和是否存在食管裂孔疝。其次，可以进行24小时反流监测，以监测食管内反流的酸度、次数、反流物在食管内停留的时间、反流物的高度、以及反流部位。
食管动力的检查也称为食管高分辨率测压，可以明确食管的蠕动情况以及食管括约肌的功能，下食管括约肌是否存在松弛、压力不足、食管裂孔疝等表现，食管动力检查还可以进行鉴别诊断。上消化道造影即钡餐照影，属于非常常见的检查，可以明确是否存在解剖学异常，有没有胃移位到胸腔形成食管裂孔疝。
