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造成肛瘘的原因与不良的生活习惯有关。例如上厕所时看书、看报，造成下蹲或者是排便时间延长，经常的腹泻或者便秘。甚至排便不规律，长期饮酒或者是喜食辛辣食品的人群，以及结肠功能紊乱的人群。长期站立、久坐、肛周局部受凉等。肛肠疾病的发病率都会上升。
因此养成良好的生活习惯，避免以上不良因素，可以有效地预防肛瘘的发生。如果真的患上肛瘘疾病，也不要着急，积极地保守治疗和调养，可以有效地延缓肛瘘疾病的发展。肛瘘的肛周常常会粘有脓液，会引起肛周湿疹，因此排便后，淋浴或者是坐浴，以保持患部清洁的同时，保持肛周的干燥。
有的患者会用肥皂、消毒剂涂抹患处，可能会产生相反的作用。本来就很薄弱的皮肤，在药物的刺激下，会变得更脆弱。因此最好用温水轻轻地擦洗患处。
