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一般轻度的白细胞减少，患者临床上不会出现特殊的症状，多表现为原发病症状。而中度和重度的白细胞减少者极容易发生感染，会出现疲乏、无力、头晕、食欲减退等非特异性症状。
常见的感染部位是呼吸道、消化道、泌尿生殖道，患者还会伴有高热、黏膜坏死、溃疡以及严重的败血症、脓毒血症或感染性休克，严重时可以导致死亡。呼吸道可以表现为咳嗽、咳痰，甚至是憋气、咯血等。
其中消化道可以出现腹泻、腹痛等症状；泌尿生殖道可以出现尿频、尿急、尿痛、血尿等症状。
粒细胞严重缺乏时，感染部位不能形成有效的炎症反应，皮肤软组织感染常伴有脓液，X线检查可以无炎症或是浸润阴影不明显，脓肿穿刺可以没有脓液。
