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根据骨肿瘤的病理性质不同，治疗方法也不同，良性肿瘤多以局部刮除植骨或切除为主，如能彻底去除，一般不会再复发，预后良好。
而手术切除是治疗恶性肿瘤最主要手段，截肢、关节离断是常用方法。但是由于化疗越来越进步，近年来有部分学者开始做瘤段切除或全股骨切除，用人工假体置换，采取保留肢体局部，广泛切除加功能重建时，会辅以化疗等措施，目前看来是一种可取方法。
化学治疗分全身化疗和局部化疗，常用药物有阿霉素和大剂量的氨甲喋呤，按药物作用选择性不强，骨瘤细胞在分裂周期中不同步，都会影响到化疗效果。
最后，对于骨肿瘤的治疗，还包括其他一些办法，如免疫疗法、中医疗法等，效果都会不错。
