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区别在于甲亢属于甲状腺功能的诊断，是由于甲状腺合成、释放过多的甲状腺激素，造成了机体代谢亢进时可以引起一系列的临床表现，像怕热多汗、食欲亢进、消瘦、心慌、情绪紧张以及脾气暴躁等。
严重者可出现昏迷，出现甲亢危象，危及生病，同时典型的患者可以有突眼、眼睑水肿等体征。而桥本甲状腺炎则属于是一个病因诊断，这种疾病有遗传倾向。
桥本甲状腺炎是一种自身免疫性疾病，由于甲状腺球蛋白抗体和甲状腺过氧化物酶抗体的升高，这两项抗体升高会自动攻击自身甲状腺组织细胞，对甲状腺功能的影响是不一样的，既可以引起甲亢，也可以引起甲减。
桥本甲状腺炎患者也可以没有症状，甲功正常，像合并上呼吸道病毒感染、内分泌功能紊乱，或者有肿瘤、严重的感染性疾病、减肥、妊娠过程中均可以引起本病。
