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复杂性尿路感染在临床上可以分为以下几个类型，第一，存在尿道畸形的病人，假如有重复肾畸形，有结石发生，有肾下垂发生或是马蹄肾畸形或是有梗阻，此时发生的尿路感染则为复杂性尿路感染。
第二，使用器械检查，比如ICU的病人或是泌尿外科的病人，从尿道里滞留管道，进行检查，检查时出现损伤，此时感染为复杂性尿路感染。
第三，免疫系统比较差的病人，假如有糖尿病、肿瘤或是有恶液质即已经严重营养不良的病人，此时出现的感染为复杂性的尿路感染。
第四，肾移植，此时的感染属于复杂性的感染，因为肾移植需要使用大量的免疫抑制剂，其引起的感染都是很难治疗的细菌，从而称为复杂性尿路感染。
第五，反复治疗效果不好，产生耐药的病人发生感染，也是复杂性尿路感染。
第六，特殊类型的真菌、霉菌、其它的绿脓杆菌感染，也属于复杂性尿路感染的范畴。复杂性尿路感染，特别是老年人，会导致长时间反复的感染，从而造成肾功能的损害，所以需要多加小心。
