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治疗方式的优缺点，主要在于创伤性的干预性治疗，分为三种：手术治疗、腔镜治疗和微波治疗。
手术治疗是传统方式，最大的优点是成熟，目前的手术方式分为三种，一种是腺叶切除，一种是近全切，还有一种是全切。
对传统手术而言对结节治疗是最确切的，治疗效果也是最好的。缺点是颈部会留有疤痕，对于很多爱美的女士会认为疤痕会影响到美观，所以不少病人会抗拒手术。
随着腔镜的技术发展，也出现腔镜手术，通过特殊的器械在两侧腋窝，甚至在口腔里进行录入，用二氧化碳把皮瓣分离形成一个空腔，在空腔里通过电视进行手术切除，最大的好处是脖子上不留疤痕，但是缺点同样也很多。
腔镜手术的缺点首先创伤很大，比传统手术方式创伤要大很多，如果是经过口腔地方进去，手术创口会被口水当中细菌所污染，感染率会升高。
其次，如果结节是恶性的，需要做中央区淋巴结清扫，腔镜手术对清除中央区淋巴结是无能为力的，在某个死角地方，会出现很多的残留，有很大的局限。
腔镜手术是一次性的手术，出现复发时需要再次做手术，粘连会非常严重，原来没有动过的地方，要形成一个腔，所以很多地方会粘连严重，再次手术的风险比传统手术进行二次手术的风险要高很多。
患者也可以进行消融治疗，消融治疗是一根针插在脖子里面去，在B超引导下进到一个结节当中，通过微波进行消除结节。
消融治疗优点是创伤很小，但缺点是把大结节变小结节，不能把所有的结节部分全部很干净的烧灼掉，因为要注意保护甲状腺后方的神经，不能用于恶性肿瘤，也不能完全消除结节。
