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甲状腺炎的诊断标准需要进行区分，包括慢性甲状腺炎、亚急性甲状腺炎、急性甲状腺炎。
慢性甲状腺炎最常见的是桥本甲状腺炎，即慢性淋巴细胞性甲状腺炎，主要是由于免疫相关因素所致甲状腺组织中有大量淋巴细胞或者浆细胞侵润，正常甲状腺滤泡被破坏，甚至出现纤维化。
早期桥本甲状腺炎患者仅出现甲状腺抗体水平升高，后期可能会进展为甲状腺激素水平降低，即甲减阶段。患者通过超声检查，有回声增粗、不均或者网格样改变或是弥漫性病变，患者需要长期随诊。
甲状腺亚急性炎症，临床表现主要包括发热、颈部疼痛，甚至出现甲亢高代谢症状。患通过甲功检查可能会出现甲亢表现，但是亚甲炎有一定自限性，很多患者经过一段时间即可自行好转。
还有急性甲状腺炎症、化脓性炎症，可能是由于金葡菌感染等，患者可能会出现发热、颈部明显包块，可以通过血液检测、超声、CT检查，患者还可以进行甲状腺穿刺明确。
