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神经母细胞瘤初发症状往往不典型，因此在早期诊断有所困难，比较常见症状包括疲乏、食欲减退、发烧及关节疼痛。肿瘤所导致症状取决于肿瘤所处器官及其是否发生转移。
腹腔神经母细胞瘤一般表现为腹部膨隆及其便秘，胸腔神经母细胞瘤一般表现为呼吸困难，脊髓神经母细胞瘤一般表现为躯干和躯体力量减退，患者往往会有站立行走的困难。腿部及其胯部等骨头转移神经母细胞瘤可表现为骨痛或者跛行。
另外，有些罕见病例找不到原发灶，罕见但具有特征性临床表现，包括脊髓横断性病变、脊髓压迫、顽固性腹泻、Hornor综合征、共济失调以及高血压等。
