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甲亢的预后效果较好，经过规范的口服药物治疗，一般一年半到两年的时间，甲亢水平就能恢复正常，对各个脏器也不会造成后遗症，但是甲亢复发率比较高，可以达到50%，甚至个别患者会反反复复的复发，前后治疗需要数十年时间。
部分患者由于甲亢没有及时的治疗，导致身体脏器的损伤，比如甲亢性心脏病，容易导致心律失常、心衰，部分患者可以引起永久性的心律失常。
另外甲亢突眼，预后效果较好，甲亢缓解之后突眼症状就能缓解，但是恶性突眼的治疗比较复杂，即使甲亢正常之后，可能突眼也不会得到很好的缓解。
所以甲亢大多数预后都很好，但是极个别甲亢也会发生危险情况。
