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冠脉介入治疗属于一种微创的介入手术，总体来说安全性很好，但的确却存在着一定的风险，风险的大小不能一概而论，和医生技术的熟练程度、冠脉病变的程度、病变的部位，以及患者自身的身体状况密切相关。比如患者的心功能很好，病变也局限，钙化也不重，而且又是择期手术，能够进行充分的准备，则手术的风险就会很低。
相反，如果对于急性发作的病变，急性的急诊手术，另外患者高龄、心功能差、血管病变病情又比较重、钙化严重，则手术的风险就是大大的增加的，主要可能出现的风险包括，比如造影剂的过敏、穿刺部位的出血、血肿，以及血管的损伤。
另外在导管进入血管以后，还可能刺激血管以后造成血管的严重痉挛，最严重的时候有时候可能会影响导管的拔出。
导管还能诱发心肌梗塞、急性心肌缺血，甚至可以造成冠脉损伤以及冠脉的血管穿孔，血管的穿孔、心肌的损伤可以造成心包积液、心包填塞等。
