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性功能障碍的原因总体来说有心理因素、内分泌异常、血管神经因素等，是很复杂的。性功能障碍是一个症状，这个症状可能很多的原因可能会引起，多数情况下比方在40岁以下的男性当中，有70%左右的人有不同程度的心理因素，这种心理因素就是在夫妻生活当中不能够放松，比方双方关系不好，紧张、焦虑或者没有自信心等，都是心理因素，或者没有欲望，可以引起性功能障碍。
另外一些原因比较常见的，包括糖尿病、血脂高、外伤、手术、药物，都有可能会引起性功能障碍。糖尿病为例，糖尿病病人当中有6、70%的人有不同程度的性功能障碍，因为糖尿病会损伤阴茎海绵体的血管和神经，导致性功能障碍。
还有其它的因素，比方外伤、手术，像泌尿外科的前列腺癌根治手术，因为前列腺是在膀胱和尿道之间，支配阴茎海绵体的神经从前列腺和尿道交界的地方进入海绵体，在前列腺手术的时候，容易把此神经损伤，所以也会导致性功能障碍，导致勃起功能障碍，总体来说，如果有性功能障碍，一定要找到原因，其原因是比较复杂的。
