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HPV疫苗不仅从理论上可以预防HPV感染及其相关的疾病，尤其是子宫颈癌和癌前病变，接种后世界范围内的数据已经支持了这个结论。到目前为止，已经有130多个国家和地区引进了HPV疫苗，其中截止到2017年3月31号已经有71个国家和地区将HPV疫苗纳入到政府的计划免疫当中。
从目前接种了两亿多支的HPV疫苗的监测数据显示，HPV疫苗对于9-45岁的女性均有预防效果，已经大大的降低了子宫颈癌及癌前病变的发生。如果女性能够在首次性生活之前接种HPV疫苗，其预防效果就是更为显著。
此外HPV的疫苗根据美国接种的16、18、6和11型的四价疫苗统计后，青少年女性的HPV感染率下降了56%，生殖器的疣也降低了80%-90%，在2007-2011年，15-24岁，没有接种的男性湿疣也减少了70.6%，获得了人群免疫的效果。
如果HPV疫苗的接种的覆盖率能够达到70%以上，则CINⅠ的病变就会降低35%，CINⅡ的病变可能就会降低46%。在我国进行的一项四价疫苗的三期临床试验当中，3000名的20-45岁的女性接种四价疫苗后HPV感染率降低了91%，随访了6年多，没有发生HPV宫颈病变和高级别病变，保护效率达到了100%，因此可以说HPV疫苗确实能够预防与HPV感染相关的疾病。
但是由于导致子宫颈癌的高危性型别很多，14种即使是九价疫苗，也仅能预防90%的子宫颈癌和癌前期病变，所以希望在接种疫苗之后也要定期进行筛查。
