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HPV阳性的女性接种疫苗也可以有效，我国四价疫苗的三期临床试验结果显示在接种疫苗随访的78个月当中，无论对20-26岁的女性还是26-45岁从未感染过HPV的女性，避免了患有高级别病变达到了100%的效果。
国外的资料表明，对于从未感染过HPV的女性，接种HPV以后可以避免患高级别病变，能达到98%。对于一过性女性感染的年轻女性，即使曾经检查到HPV阳性之后，后来也可能自然清除，其预防效果也是很满意的。
对于16-26岁的女性，可以达到100%;对于24-45岁的女性，可以达到66.9%，对于检查HPV阳性及正在感染或者持续感染也会有不同程度的预防作用，因此疫苗是多价的，即使感染了其中的一型，疫苗还可以预防其它的型别。
世界卫生组织2017年的立场文件提出，不推荐在接种HPV疫苗前进行HPV或艾滋病检测，因为HPV感染或既往有HPV感染这样的女性朋友也从中可以受益。2017年，美国妇产科医师协会也提出了不建议在接种疫苗前进行HPV-DNA检查，但是仍然要进行HPV筛查，这个是非常重要的。
