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对于高血压的鉴别诊断实际上相对比较复杂，一般三甲医院可能也不能够全面地进行诊断，有时候还需要到高血压专科才能进行这样相关的诊断。其中比较核心的就是排除继发性的高血压的因素，这些因素主要包括血管方面的因素，比如要做肾动脉的B超，要做主动脉的胸片或者主动脉的CTA，看看主动脉有没有缩窄，肾动脉有没有狭窄，这种动脉狭窄引起的高血压。除此之外，要判断一下肾脏的功能，做肾脏的B超，看看有没有肾脏损伤所引起的高血压，也就是肾源性的高血压，肾实质损伤引起的高血压。
除此之外，还有一大类是内分泌因素引起的高血压。这类高血压，往往是由于比较明确的身体出现了一些良性的或者说恶性的肿瘤，这些肿瘤可以持续地在血里面分泌一些激素，这些激素可以引起血压增高。这样的情况，往往也是继发性高血压需要筛查的这样一个标准。近两年来，在继发性高血压当中还一个非常重要的筛查，就是夜间睡眠呼吸暂停综合征引起的高血压，所谓夜间睡眠呼吸暂停综合征也就是在夜间患者出现打鼾的情况，而且打鼾非常严重，有这种憋气的情况。如果夜间长期地存在一种低氧低通气的状态，也会造成继发性的高血压。当在临床上使用不同的诊断手段，把其他的继发性高血压排除之后，可以进行一个原发性高血压的诊断。
不是每一个高血压的患者都要进行这么复杂的继发性高血压的鉴别诊断，往往是用在一些非常年轻的，没有家族史的高血压的患者，比如说20岁就发生高血压或者30岁就发生高血压，家里面也没有明确的这样高血压的家族史，要进行上述的这些全面的继发性高血压的排查。还有一大类，就是用了高血压药物，血压控制不好，这往往提示有一些特殊的原因造成了血压增高，而经典的一些传统的药物无法控制血压，这时候要进行全面的高血压的筛查。总体来说，对于原发性高血压的一个确诊，部分患者需要进行全面的继发性高血压的一个排除性的诊断。
