鸡内金的副作用为胃肠道不适、过敏反应等；禁忌为脾胃虚弱无积滞者、孕妇、过敏体质者等。
一.副作用
1.胃肠道不适
个别人群可能出现胃肠道不适症状，如恶心、呕吐、腹痛、腹泻等。有研究表明，当鸡内金服用剂量过大或服用方式不当时，可能刺激胃肠道黏膜，导致胃肠功能紊乱。例如，部分人一次性大量服用鸡内金后，胃肠蠕动加快，从而引发上述不适表现，但这种情况相对较少见，多与不合理的用药情况相关。
2.过敏反应
极少数人可能对鸡内金过敏，表现为皮肤瘙痒、皮疹、红斑，严重时可能出现呼吸困难等过敏症状。这是因为个体的特异性体质，机体将鸡内金识别为过敏原，从而引发免疫反应。不过，鸡内金引起过敏的发生率非常低。
二.禁忌
1.脾胃虚弱无积滞者
鸡内金有消食化积的作用，对于本身脾胃虚弱且没有食积的人群，使用鸡内金可能会进一步耗伤脾胃之气，导致脾胃功能更差，出现乏力、消化不良加重等情况。因为这类人群脾胃运化功能本就较弱，再用鸡内金消食，会过度损耗正气。
2.孕妇
孕妇属于特殊人群，目前虽然没有大规模的临床研究表明鸡内金对孕妇绝对不安全，但从谨慎用药角度考虑，由于其可能对胃肠功能有一定影响，为避免对孕妇及胎儿可能产生的潜在不良影响，孕妇应慎用鸡内金。因为孕妇的身体处于特殊的生理状态，任何药物的使用都需要格外谨慎，以防对胎儿发育等造成未知影响。
3.过敏体质者
明确对鸡内金过敏的人群绝对禁忌使用鸡内金，以免引发严重过敏反应。过敏体质者本身机体免疫状态较为特殊，接触到鸡内金后更容易发生异常免疫应答。
