心肌肥大一般没有最好的治疗方法，造成心肌肥大的原因有很多，患者应通过治疗原发疾病来改善症状，不同的原因，最好的治疗方法不同。
1.肥厚型心肌病：肥厚型心肌病患者可在医生的指导下使用非二氢吡啶类钙通道阻滞剂，比如地尔硫维拉帕米等，药物治疗无效的患者还可进行手术治疗，比如室间隔切除术。
2.高血压：当血压长期处于升高状态时，会加重心脏的负荷，从而会使心肌肥大，患者可在医生的指导下进行药物治疗，常用的药物主要有氢氯噻嗪美托洛尔硝苯地平等，该疾病一般不需要进行手术治疗。
心肌肥大也可能是由长期高强度运动训练所导致，一般不需要进行特殊治疗。
