克罗恩病和肠结核是两种不同的疾病，它们之间的主要区别有原因、症状、治疗方面等不同。
克罗恩病是一种原因不明的肠道炎症性疾病，可能与遗传、感染、环境、免疫等因素有关。其症状包括腹痛、腹泻、腹部包块、营养障碍等，且可能伴随有关节疼痛、皮疹、口腔溃疡等肠外表现。克罗恩病的病变多位于末端回肠和右半结肠，病程多迁延，反复发作，不易根治。
肠结核则是结核分枝杆菌引起的肠道慢性特异性感染，常继发于肺结核。其临床表现主要为腹痛、腹泻、便秘等，同时可能伴有腹部包块和全身症状如发热、盗汗等。肠结核的治疗主要以抗结核药物治疗为主，必要时可进行手术治疗。
