胃肠神经官能症的中药治疗需结合辨证分型，常见证型包括肝气郁结型、脾胃虚弱型、心脾两虚型及阴虚火旺型，不同证型适用不同中药方剂。
肝气郁结型患者可选用逍遥散加减，能疏肝理气、调和脾胃，缓解情绪相关的胃肠不适；脾胃虚弱型多用香砂六君子汤，健脾益气、化湿和中，改善腹胀、食欲不振等症状；心脾两虚型可服用归脾汤，益气补血、健脾养心，适用于伴随心悸、失眠的胃肠功能紊乱；阴虚火旺型常用益胃汤，滋阴养胃、清热生津，缓解口干、嘈杂等症状。
特殊人群中，孕妇需在医师指导下用药，避免影响胎儿；哺乳期女性应注意中药成分对婴儿的潜在影响；老年患者代谢较慢，需调整用药剂量以降低不良反应风险；儿童（尤其是婴幼儿）应优先考虑非药物干预，避免盲目使用成人中药方剂。
中药治疗需在专业医师指导下进行，严格遵循辨证论治原则，避免自行用药。非药物干预如规律作息、饮食调整及心理疏导对改善症状同样重要，可作为基础辅助措施。
