慢性肾小球肾炎的发病原因复杂，涉及免疫介导的炎症反应、遗传因素、感染、药物及毒物损伤等多种因素，多数与自身免疫异常相关。
免疫介导性损伤是主要病因，机体产生针对肾小球基底膜或免疫复合物的抗体，激活补体系统引发炎症反应，如IgA肾病、狼疮性肾炎等均为此类机制。
遗传因素在部分患者中起作用，如Alport综合征由COL4A基因突变导致，家族性局灶节段性肾小球硬化症也存在遗传倾向，需关注家族病史。
感染与慢性肾小球肾炎密切相关，细菌（如链球菌感染后肾炎）、病毒（如乙肝病毒相关性肾炎）、寄生虫感染均可通过免疫机制诱发肾脏损伤，感染控制至关重要。
药物或毒物长期暴露是重要诱因，非甾体抗炎药、某些抗生素、重金属等可直接损伤肾小管间质或肾小球，长期使用需定期监测肾功能，避免滥用药物。
特殊人群需注意：儿童及青少年高发感染相关肾炎，需及时控制感染；女性系统性红斑狼疮患者需警惕狼疮性肾炎，定期复查尿常规；老年人用药需谨慎，避免肾毒性药物叠加使用。
