发生肠系膜上动脉栓塞，一般处理的原则是：首先，非手术疗法，包括积极地治疗原发疾病，第二，行动脉造影后，动脉持续输注罂粟碱，并且可以尝试使用尿激酶动脉溶栓的疗法。第二，如果保守治疗不佳，可以选择手术治疗。手术治疗的方式，包括栓塞位于某一分支，累及局部肠管坏死，行肠段切除吻合术；第二，栓塞位于肠系膜主干的时候，全部小肠和右半结肠已经坏死，行全部小肠、右半结肠切除，术后肠外营养支持治疗；第三，栓塞位于肠系膜上动脉主干，肠管没有坏死，行动脉切开取栓术，如果取栓后肠系膜上动脉没有血流或者血流较少，应该行自体大隐静脉或人工血管，在腹主动脉或者是髂总动脉与肠系膜上动脉兼作旁路移植吻合术。
