窦性心律不齐的发病原因有生理因素、疾病因素、药物因素等。
1、生理因素
剧烈运动、情绪波动、饮酒、吸烟、饮用浓茶、过于紧张、睡眠不足等情况都会刺激交感神经，导致交感神经兴奋引发窦性心律不齐。
2、疾病因素
甲状腺功能亢进症、贫血、心肌炎、心包炎、急性心肌梗死等疾病均会引发心脏节律改变出现窦性心律不齐。
3、药物因素
服用洋地黄类、阿托品等药物会造成心脏节律改变，导致窦性心律不齐。
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