脊柱裂主要是由于胚胎期发育异常、妊娠期孕母因素等原因所引起。
1、胚胎期发育异常
脊柱由26块脊椎骨连接组成，脊柱中央为椎管，该椎管内包有脊膜、神经及脊髓等组织，如果胚胎期发育障碍导致椎管先天性发育异常，可造成椎管闭合不全，即脊柱裂。
2、妊娠期孕母因素
妊娠期孕妇接触放射线，如X射线、α射线、γ射线等，或者接触有害化学物质，如甲醛、油漆、染发剂等，或者有主动吸烟或被动吸烟史、接触过有毒物质或饮食、母体服用丙戊酸钠等药物、母亲为1型糖尿病患者等因素，均可能会导致胎儿脊柱裂的发生。
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