特发性血小板减少性紫癜的病因还不十分明确，可能与感染因素、遗传因素、免疫系统紊乱性疾病等有关。
1、感染因素
当人体受到病毒感染时，如EB病毒、疱疹病毒、人类免疫缺陷病毒等，可使体内产生相应的抗体，此类抗体会与血小板膜发生交叉反应，导致血小板受到损伤，使血小板被巨噬细胞清除，造成血小板减少，引起特发性血小板减少性紫癜。
2、遗传因素
如果家族中有人患有特发性血小板减少性紫癜，则其他家庭成员的患病几率会升高。
3、免疫系统紊乱性疾病
若患有系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等疾病，可能会导致血小板受到破坏，从而会诱发特发性血小板减少性紫癜。
