急性肾盂肾炎的病因与细菌感染、尿路梗阻及反流、身体免疫力低下等有关。
1、细菌感染
致病菌会通过尿道逆行上行造成感染，常见的致病菌为大肠埃希菌，其次还有变形杆菌、铜绿假单胞菌等。其他的感染途径还包括血行感染，即致病菌经过血液直接播散到肾盂和肾实质。身体其他部位存在感染时，细菌还会通过直接感染和淋巴途径感染导致急性肾盂肾炎。
2、尿路梗阻及反流
尿路结石及前列腺增生、肿瘤等因素会导致尿液潴留，细菌不易被清除时会在肾盂和肾实质大量繁殖引起感染。
3、身体免疫力低下
正常情况下，进入膀胱的细菌会很快被人体免疫系统清除，当人体免疫功能低下时容易发生急性肾盂肾炎，常见于糖尿病、艾滋病以及长期使用免疫抑制剂的人群。
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