肺结节病目前病因尚未完全明确，考虑与遗传易感性、环境因素、感染等有关，具体如下：
1、遗传易感性
肺结节病具有一定的遗传易感性。研究表明，嗜乳脂蛋白样基因-2、人类白细胞抗原的部分基因表型，和肺结节病的症状以及预后相关联。
2、环境因素
长期吸入黏土、松花粉等有机粉尘以及铝、锆等无机粉尘，可引起肺结节病。
3、感染
结核分枝杆菌、痤疮丙酸杆菌、带状疱疹病毒、支原体等感染，与肺结节病的发病有关。
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