真菌性角膜炎主要是真菌感染引起的。
常见的致病菌株为曲霉菌，其中多为烟曲霉菌，其次为镰刀菌、白色念珠菌。一般多见于农业性角膜外伤，如树枝、稻草、麦秆等擦伤所致。全身或局部长时间应用抗生素、免疫抑制剂、皮质类固醇等药物会导致自身免疫力低下，导致发病风险增高。另外，有佩戴角膜接触镜或既往眼部手术史的人群受感染的几率也会升高。
真菌性角膜炎一般不会自愈，需要及时接受抗菌治疗。
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