真菌性角膜炎的治疗方法有一般治疗、药物治疗、手术治疗等。
1、一般治疗
有明显诱因的患者要尽量避免诱因，如果是佩戴隐形眼镜引起的真菌性角膜炎，应该避免继续佩戴。同时要注意眼部卫生，注意安全，避免眼部再次受伤。
2、药物治疗
患者可遵医嘱局部使用抗菌药物，如0.25%两性霉素B眼药水、5%那他霉素、0.5%咪康唑、1%氟胞嘧啶等。严重真菌感染者需要联合全身使用抗真菌药物治疗，如伊曲康唑、酮康唑、氟康唑等药。
3、手术治疗
药物治疗效果不理想的患者可以考虑手术治疗，常用的手术方式有清创术、结膜瓣遮盖术和角膜移植术。
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