食管鳞状细胞癌的发病原因较为复杂，可能与遗传、烟酒刺激、不良饮食习惯、微量元素和维生素缺乏、癌前疾病、遗传因素等有关。
1、遗传
食管鳞状细胞癌具有家族遗传倾向。
2、烟酒刺激
吸烟及重度饮酒会引起食管鳞状上皮出现异型增生，从而发病。
3、不良饮食习惯
腌制食品中含有亚硝酸盐，长期摄入会导致亚硝酸盐摄入过量，而亚硝酸盐会在胃内转化为亚硝胺，从而引发食管鳞状细胞癌。另外，经常食用霉变食物，其中的黄曲霉菌、镰刀菌等真菌会促进硝酸盐还原为亚硝酸盐，还能促进亚硝胺的合成，协同致癌。
4、微量元素和维生素缺乏
饮食中长期缺乏硒、β-胡萝卜素、维生素E等也会诱发食管鳞状细胞癌。
5、癌前疾病
巴雷特食管、胃食管反流病、食管憩室等慢性食管疾病会引起食管黏膜出现炎症反应，均会导致食管鳞状细胞癌的发病率增高。
