室间隔缺损主要是遗传因素、宫内感染、母体因素等原因引起的。
1.遗传因素
室间隔缺损属于先天性心脏病，先天性心脏病一般是单基因或多基因遗传缺陷、染色体畸变而引起的。
2.宫内感染
母亲怀孕期间感染柯萨奇病毒、风疹病毒、冠状病毒等病原菌时，可引起宫腔感染，从而导致患者出现心脏发育畸形的情况，室间隔缺损形成。
3.母体因素
母亲怀孕期间接触放射线、化学性物质或患有妊娠期糖尿病、高钙血症等疾病时，可导致其出现宫内缺氧的情况，患者此时也会出现心脏发育缺陷的情况。
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