肾上腺脑白质营养不良主要是由于基因突变引起的。
基因突变是造成肾上腺脑白质营养不良的基本病因。肾上腺脑白质营养不良属于X性连锁隐性遗传病，患者从父母一方或双方中遗传致病的基因时，可造成其体内的多种氧化酶活力下降，使其出现C23～C30脂肪酸堆积的情况，堆积的部位是患者的肾上腺皮质时，可导致其出现肾上腺脑白质营养不良的情况。
由于女性有两条X染色体，因此，肾上腺脑白质营养不良对男性的影响较大。
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