小儿消化不良的诊断方法是血常规检查、幽门螺杆菌检查、消化道内镜检查等。
1.血常规检查
患者进行血常规检查时，能够根据血液中白细胞计数、中性粒细胞百分比等情况，明确是否存在感染的情况，有助于诊断本病。
2.幽门螺杆菌检查
患者通过碳14呼气试验，可以对呼出的气体进行分析，判断是否存在幽门螺杆菌感染的情况，帮助明确小儿消化不良的病因。
3.消化道内镜检查
患者进行消化道内镜检查时，能够在内镜下直接观察食管、胃和十二指肠的病变情况，判断有无器质性病变，辅助诊断小儿消化不良。
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