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慢性间质性肾炎是由不同原因导致的，总体来说，慢性间质性肾炎的预后并不是非常好，绝大多数病人可能会持续的进展。当然，也有一部分病人可能会长期保持肾功能稳定。对于药物相关性的间质性肾炎，强调的还是以预防为主。一旦发生之后，要积极地停用相应的药物，并且给予对症支持治疗，尽量延缓肾脏病的进展。对于高尿酸血症和免疫性疾病导致的间质性肾炎，应该积极的治疗原发病。因为如果早期积极有效的治疗，可以明显改善患者的预后。有一部分病人肾功能可以恢复，并且在此后保持长期的稳定。在其中特别要强调一点，就是马兜铃酸肾病病不仅仅最终会出现肾功能衰竭和尿毒症，还可能会伴发泌尿系统移行上皮的肿瘤，也就是平时所说的泌尿系统肿瘤。
如果一旦发生，会严重影响患者的预后。因此对于这部分病人，至少每年要查一次泌尿系统彩超。如果出现无痛性的肉眼血尿等泌尿系统肿瘤的征象，一定要及时就诊，从而早期发现泌尿系统肿瘤，改善患者的预后。
