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克罗恩病是和免疫相关的小肠疾病或者消化道疾病。最容易发生部位主要是回肠末端和小肠，消化道各个部位都可以发生，可以被称为食道克罗恩、胃克罗恩、结肠克罗恩。最容易发生的部位是小肠，尤其是回肠末端。
克罗恩病病变表现不连续。主要肠镜下可以看到回肠末端铺路卵，即为铺路卵石样改变，甚至可以出现裂隙样溃疡。克罗恩病发病都比较年轻，20岁左右。
患者还可以出现肛周病变，比如肛裂、肛周脓肿，所以克罗恩病也是消化道疾病，也是免疫相关性消化道疾病。患者还可以出现关节改变、皮肤改变、虹膜睫状体炎、肠外表现。还可以合并原发性硬化性胆管炎，克罗恩病是消化道疾病，也是免疫性疾病，也是目前消化道疾病比较难诊、断难治疗的疾病。目前也是消化科医生研究的热点疾病。
