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脑起搏器手术是一种比较安全的手术，实际上是微创的操作，大体的过程分为两个部分。第一部分是在立体定向的技术支持下，把电极放到脑内特定的核团，这一步可以在局麻或者全麻下完成。第二步是把已经放好的电极连接上延长导线，和胸前的脉冲发生器，也就是普通人俗称的电池，放到胸部的皮下需要在全麻下进行。
现在可以拿头的模型演示一下，首先可以看到鼻子，如入路的点是在额部钻孔，然后把电极顺着这个孔放进去，现在电级是带着导丝的，手术的时候这根导丝是会被拔掉的。电极非常柔软，放进去以后，在体内可以做成盘，盘在皮下。长度还不足以延长到胸前来，还可以通过延长导线的帮助，最后会连接到很小的脉冲发生器上，里面是装有电池和所有的驱动的程序的，会放到胸前，差不多现在手放的位置。
整个操作过程就是这样，总体手术时间差不多在四个小时左右，但是病人的创伤还是比较小的，出血量一般会控制在一百毫升左右。因为病人大部分都是老年人，甚至有各种合并症，太大的创伤，这些病人也很难去接受，整个过程下来，病人的安全度还是比较高的。
