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由于胃息肉是良性病变，而且增生性息肉所占良性息肉达到90%，因此小的增生性息肉或者炎性息肉，因为没有癌变的潜能，可以不做处理，患者定期复查即可。
临床上需要通过病理学检查明确息肉的性质，所以为了便于活检，一旦发现息肉，可以行内镜下直接活检前钳除，摘除以后再送检。内镜下如果发现小息肉，一般不会引起临床症状，如果患者出现消化不良、慢性炎症，胃内息肉多数都是胃镜检查时发现。对于这类患者，通常以药物治疗为主，并定期复查。
胃窦增生性息肉与幽门螺杆菌感染有关，再加上胃黏膜的慢性炎症，所以部分患者在根除幽门螺杆菌之后，部分息肉也可以消退。
对于较大的息肉，即使可能是良性息肉，没有癌变潜能，如果组织学证实为腺瘤性息肉，为避免引起息肉出血或者造成梗阻或者癌变，被发现之后患者可以行内镜下摘除。
