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溃疡性结肠炎的临床表现通常是反复的腹痛、腹泻。其中腹泻往往是黏液脓血便，如果累及到直肠，还会有里急后重的表现。
部分病人还会出现下消化道的出血、穿孔，甚至是癌变。同时还有可能会产生并发症，溃疡性结肠炎比较常见、严重的并发症是中毒性巨结肠。
患者除了有消化道的症状外，还有的患者可能会出现肠外症状，譬如出现虹膜炎、口腔溃疡等。也有部分患者会有皮肤的病变，比如出现间歇性红斑、脓皮病等。
还有部分患者会出现关节的表现，小关节、大关节都有可能会被累及到，比如膝关节、踝关节等小关节可以出现红肿的表现，而累及到大关节可能会引起强直性的脊柱炎。
另外，溃疡性结肠炎还有可能会累及到肝胆系统，可引起患者出现原发性硬化性的胆管炎表现。
