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疫苗不良反应主要是因为疫苗本身特性引起的，与预防接种目的无关或者意外的反应，一般与受种者的个体差异有关系。
疫苗不良反应包括了一般反应和异常反应，一般反应主要是指受种者发生的一过性或者轻微的机体反应。例如接种部位红肿、硬结、疼痛等局部反应，还有发烧、乏力、头痛等全身反应。
异常反应主要是指造成了受种者的器官或者功能损害的相关反应。例如急性炎症的过敏性休克、不伴休克的过敏反应，例如荨麻疹、斑丘疹、喉头水肿等等，还有就是中毒性休克、晕厥、癔症、全身化脓性感染等等，更严重的甚至还有脑病、脑炎、脑膜炎、血小板减少性紫癜、格林-巴利综合征、疫苗相关麻痹性的脊髓灰质炎等等。
