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慢性肾炎的病因不是很明确,少数是由急性链球菌感染后引起的急性肾炎发展而来。急性肾炎直接迁延或者临床痊愈,若干年以后再出现慢性肾炎。但大部分的慢性肾炎并非急性肾炎导致,而是由其它原发性肾小球疾病直接迁延发展而成,起病即是慢性肾炎。
慢性肾炎的病因、发病机制和病理类型不尽相同,起始的因素多为免疫介导的炎性反应,导致病程慢性化的机制除了免疫激素以后,非免疫、非炎症因素也占有重要的作用,常见的类型是系膜增生性肾小球肾炎、系膜毛细血管性肾小球肾炎、膜性肾病及局灶节段性肾小球硬化等,其中少数是由非系膜增生性肾小球肾炎转化而来,病变进展至后期转变为程度不等的肾小球硬化,相应肾单位的肾小管萎缩、肾间质纤维化,称为硬化性肾小球肾炎。