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甲胎蛋白是临床常用的肿瘤标志物，往往是和原发性肝癌相关，但是甲胎蛋白并不是一个绝对诊断肝癌的指标，因为甲胎蛋白升高往往还合并其他的一些原因，最常见的原因，比如同时合并了肝炎、肝硬化的情况，还有女性在怀孕期间甲胎蛋白也会升高，或者同时合并了生殖系统的肿瘤，甲胎蛋白也会升高。还有一些少见的疾病，比如胃的肝样腺癌，甲胎蛋白也会升高。发现甲胎蛋白升高的时候，除了要检查肝脏之外，还要检查其他的一些情况。
在中国的指南当中，把甲胎蛋白分为一个数，就是大于等于400。指南当中指出，如果大于等于400，排除了其他的一些情况，比如说妇女的妊娠，比如说肝硬化或者是生殖系统肿瘤，就要高度考虑是否患有原发性的肝细胞癌了。
