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原发性中枢神经系统淋巴瘤干细胞移植治疗是指在化疗前，把病人骨髓里造血干细胞取出来冷藏，这时尽可能提高化疗剂量，然后把自体干细胞输回来，这样就避免了骨髓移植。
原发性中枢神经系统淋巴瘤化疗也好、放疗也好，如果为了提高疗效、为了使消灭肿瘤细胞更干净，提高剂量，但提高到一定剂量时候，有一种严重副作用就是骨髓移植，人为因为化疗引起再生障碍性贫血，化疗药物不仅能够治疗淋巴瘤，还把骨髓破坏掉，出现了白细胞减少引起了感染、红细胞减少引起贫血、血小板减少引起出血，当化疗药物过大会引起死亡，要治疗相关感染等等。
医生通过用一种办法挽救骨髓损害，又能尽可能提高剂量，用自己造血干细胞移植支持下大剂量化疗，比如原发性中枢神经系统淋巴瘤干细胞移植治疗，就像自体输血一样，自体干细胞输回来就避免一下骨髓移植，因为这种化疗引起造血功能不好，就叫中枢神经系统淋巴瘤自体造血干细胞移植技术，这个技术本身不是太复杂，但是因为病例比较少，国内外在这方面，特别是在国外大中心做了一些工作，用的这种方法以后也免不了复发，病人总存活现在和其它治疗一比较，也没有太大差别，对于这种方法还是值得进一步探讨。
