肝内胆管结石是多种因素共同作用的结果，包括胆道感染（细菌、寄生虫感染）、胆汁成分异常（胆盐等代谢失衡、胆汁淤滞）、胆道解剖结构异常（肝内胆管解剖变异、Oddi括约肌功能异常）以及其他因素（年龄性别、生活方式、病史因素）。
一、胆道感染因素
1.细菌感染：胆道系统发生细菌感染时，细菌及其产生的毒素等物质可作为核心，促使胆盐、胆红素等成分沉积。例如，大肠杆菌等常见致病菌感染胆道后，会改变胆汁的理化性质，使得胆汁中的成分更容易析出形成结石。在一些研究中发现，长期反复的胆道感染患者，肝内胆管结石的发生率明显高于无胆道感染人群。
2.寄生虫感染：如肝吸虫感染较为常见，肝吸虫在胆道内寄生，其虫卵、死亡的虫体等可成为结石的核心，同时肝吸虫感染会引起胆道的炎症反应，影响胆汁的正常排泄和成分，从而促进肝内胆管结石的形成。有流行病学调查显示，肝吸虫流行地区的肝内胆管结石发病率显著升高。
二、胆汁成分异常
1.胆盐、胆固醇、胆红素代谢失衡：正常情况下，胆汁中的胆盐、胆固醇、胆红素等保持相对稳定的比例。当某种因素导致这种比例失调时，就容易形成结石。例如，胆固醇分泌过多或胆盐、卵磷脂合成减少时，胆固醇就容易析出形成胆固醇结石；而胆红素代谢异常，如葡萄糖醛酸酶活性增高，使结合胆红素水解为非结合胆红素，与钙结合形成胆红素钙结石。
2.胆汁淤滞：胆道的狭窄、胆道畸形等因素可导致胆汁排泄不畅，胆汁在胆管内淤积，胆汁中的水分被吸收，胆盐等成分浓度增高，促使结石形成。比如先天性胆道狭窄的患者，由于胆道的正常结构异常，胆汁引流受阻，肝内胆管结石的发病风险明显增加。
三、胆道解剖结构异常
1.肝内胆管解剖变异：肝内胆管存在多种解剖变异情况，如肝内胆管分支过细、走行迂曲等，这些变异使得胆汁引流不畅，增加了结石形成的几率。例如，部分人群肝内胆管分支呈过于纤细的树枝状，胆汁在其中流动缓慢，容易导致胆盐等成分沉积形成结石。
2.Oddi括约肌功能异常：Oddi括约肌功能障碍时，可引起胆道内压力改变，影响胆汁的正常排出，导致胆汁在胆管内淤积，进而促进结石的形成。无论是Oddi括约肌痉挛还是松弛功能异常，都可能打破胆道内的胆汁流动平衡，增加肝内胆管结石的发生风险。
四、其他因素
1.年龄与性别：一般来说，中年人群相对更易患肝内胆管结石，这可能与中年时期人体的代谢功能、胆道结构等有一定关系；在性别方面，男性和女性的发病率有所差异，可能与激素水平等因素对胆道生理功能的影响有关，但具体机制仍需进一步深入研究。
2.生活方式：长期高脂、高糖饮食的人群，胆汁中胆固醇等成分含量可能升高，增加胆固醇结石形成风险；而长期低纤维饮食可能影响胆汁的排泄和肠道对胆汁酸的重吸收等，间接影响胆道内环境，增加结石形成几率。此外，长期饮水过少，尿液浓缩，也可能影响到胆道内胆汁的成分和流动，与肝内胆管结石的形成有一定关联。
3.病史因素：有胆道蛔虫病史的患者，蛔虫残体或虫卵可成为结石核心，而且蛔虫感染引发的胆道炎症会破坏胆道内环境，容易导致结石形成；既往有胆道手术史的患者，胆道结构可能受到一定影响，胆汁引流可能出现异常，增加了肝内胆管结石复发或新发的风险。
