新生儿便秘的原因包括饮食因素（母乳喂养时母亲饮食影响，人工喂养时配方奶粉及冲调方法影响）、消化系统发育不完善（肠道神经调节和肌肉功能不完善）、疾病因素（先天性肠道畸形、甲状腺功能减退）以及其他因素（环境改变、心理因素）。
一、饮食因素
1.母乳喂养
若母亲饮食中缺乏膳食纤维等营养成分，可能通过母乳影响新生儿。比如母亲长期摄入过于精细的食物，母乳中相应营养物质含量相对不足，可能导致新生儿肠道内食物残渣少，引起便秘。研究表明，母亲饮食结构与新生儿排便情况有一定关联，当母亲增加蔬菜、水果等富含膳食纤维食物的摄入后，新生儿便秘情况可能得到改善。
2.人工喂养
配方奶粉中酪蛋白含量较高，在肠道内容易形成较硬的凝块。如果冲调奶粉的方法不当，如奶粉浓度过高，会使新生儿肠道内消化吸收困难，进而引发便秘。不同品牌的配方奶粉成分虽有差异，但都可能存在因奶粉特性导致新生儿便秘的情况，有研究显示，约一定比例的人工喂养新生儿便秘与配方奶粉的蛋白质组成等因素相关。
二、消化系统发育不完善
1.肠道神经调节功能
新生儿肠道的神经调节系统尚未完全发育成熟，对肠道蠕动的控制不够精准。例如，肠道的推进性蠕动可能出现不协调的情况，导致粪便在肠道内传输缓慢，从而引发便秘。这种神经调节功能的不完善是新生儿阶段的生理特点，随着新生儿的成长，肠道神经调节逐渐完善，便秘情况可能会有所改善。
2.肠道肌肉功能
新生儿肠道的肌肉力量相对较弱，特别是结肠的蠕动能力有限。这使得粪便在肠道内移动的速度减慢，容易在肠道内停留时间过长，水分被过度吸收，进而导致粪便干结，引起便秘。一般来说，新生儿出生后的前几个月，肠道肌肉的发育尚不完全，这种情况较为常见。
三、疾病因素
1.先天性肠道畸形
如先天性巨结肠，是由于直肠或结肠远端的肠管持续痉挛，粪便淤滞在近端结肠，使该段肠管肥厚、扩张。这是一种较为严重的先天性肠道疾病，会导致新生儿出生后就出现顽固性便秘，并且常伴有腹胀等症状。通过相关影像学检查等可以明确诊断先天性巨结肠。
2.甲状腺功能减退
甲状腺激素对机体的新陈代谢等多种生理功能有调节作用。新生儿甲状腺功能减退时，机体代谢率降低，胃肠蠕动减慢，从而出现便秘的症状。同时还可能伴有反应迟钝、皮肤黄染、喂养困难等其他表现，通过甲状腺功能检查可以确诊甲状腺功能减退导致的便秘。
四、其他因素
1.环境改变
新生儿更换生活环境时，可能会因为对新环境不适应，出现排便规律的改变，导致便秘。比如从熟悉的家庭环境转到医院等新环境，生活节奏、饮食等方面的变化可能影响新生儿的排便。
2.心理因素
虽然新生儿心理因素相对不那么突出，但也可能存在因情绪紧张等导致的便秘情况。例如，新生儿受到惊吓等不良刺激后，可能会影响肠道的正常蠕动功能，进而引发便秘。不过这种情况相对较少见，但也是需要考虑的一个方面。
