儿童肠梗阻的常见原因包括先天性肠道畸形（如肠闭锁、肠狭窄、肠旋转不良）、肠套叠、腹外疝嵌顿、肠道炎症（如坏死性小肠结肠炎、肠炎）、腹部术后粘连、寄生虫感染（如蛔虫团肠梗阻）。
肠狭窄：可能与胎儿期肠管血液循环障碍有关，使肠管某段发育不良，形成狭窄，影响肠道内容物通过。
肠旋转不良：胚胎期肠管以肠系膜上动脉为轴心的旋转运动发生障碍，导致肠道位置异常，容易引发肠梗阻，常于出生后数天内发病。
肠套叠
多见于婴幼儿，尤其是4-10个月的婴儿，发病原因可能与饮食改变（如添加辅食）、肠道感染、过敏等因素有关，使近端肠管套入远端肠管，造成肠腔梗阻。
腹外疝嵌顿
儿童常见的腹外疝如腹股沟疝、脐疝等，当疝内容物（多为肠管）不能回纳时，就会发生嵌顿，导致肠梗阻。通常是由于孩子剧烈哭闹、腹压突然增高等原因，使疝内容物被卡在疝环处，影响肠道通畅。
肠道炎症
坏死性小肠结肠炎：多发生在早产儿或有围生期窒息、感染等情况的新生儿，肠道发生炎症、坏死，可导致肠腔狭窄、梗阻，病情较重，常伴有腹胀、便血等表现。
肠炎：一些肠道感染性疾病，如细菌性痢疾、病毒性肠炎等，炎症导致肠道黏膜充血、水肿，甚至渗出物增多，可能引起肠道部分梗阻，常见于儿童感染性疾病过程中。
腹部术后粘连
儿童如有腹部手术史，如先天性消化道畸形矫治术等，术后可能发生肠粘连，这是腹部手术常见的并发症之一。粘连的肠管可能形成锐角，导致肠道内容物通过障碍，一般在术后数月至数年均可发生。
寄生虫感染
如蛔虫团肠梗阻，多见于6-8岁学龄儿童，因蛔虫聚集成团，堵塞肠腔引起梗阻，常与儿童不注意饮食卫生，吞食大量蛔虫卵有关。
