石斛花有一些禁忌需注意，体质虚寒者慎用，孕妇需谨慎，过敏体质者需警惕，还可能与某些药物发生相互作用。
石斛花性微寒，对于体质虚寒的人群来说，过多食用可能会加重体内的寒凉之气，引发腹痛、腹泻等不适症状。例如，一些本身就有脾胃虚寒、手脚冰凉表现的人群，若大量服用石斛花，可能会进一步损伤脾胃阳气，影响消化功能。
孕妇需谨慎
目前虽然没有明确的大规模临床研究表明石斛花对孕妇绝对有害，但由于其药性的特殊性，为了确保孕妇和胎儿的安全，孕妇在食用石斛花前应咨询医生的意见。因为孕期女性的身体处于特殊状态，对药物或食物的反应可能与常人不同，需要专业医生根据个体情况来判断是否适宜食用。
过敏体质者需警惕
部分过敏体质的人群可能对石斛花中的某些成分过敏，食用后可能出现过敏反应，如皮肤瘙痒、皮疹、呼吸困难等。所以过敏体质者在接触或食用石斛花之前，最好先进行小范围的过敏测试，若出现过敏迹象应立即停止食用并就医。
与某些药物的相互作用
石斛花可能会与一些药物发生相互作用，影响药物的疗效或增加不良反应的发生风险。例如，正在服用某些降血糖药物的患者，如果同时食用石斛花，由于石斛花可能具有一定的降血糖作用，需要密切监测血糖变化，防止血糖过低；而正在服用其他中药材的患者，也应告知医生自己食用石斛花的情况，以便医生评估药物之间的相互作用。
