鼻咽炎根据病程分为急性鼻咽炎与慢性鼻咽炎，根据病程的不同，发病原因有所区别。
1、急性鼻咽炎
急性鼻咽炎大多是致病菌感染引起的，常见的致病菌有鼻病毒、冠状病毒、腺病毒、埃可病毒、柯萨奇病毒以及溶血性链球菌、葡萄球菌、肺炎链球菌等。此外，受凉、淋雨、过度疲劳导致免疫功能下降，可增加急性鼻咽炎的患病几率。
2、慢性鼻咽炎
当急性鼻咽炎治疗不当或反复发作时会迁延为慢性鼻咽炎;其次，可能是邻近组织感染造成的，如鼻腔或鼻窦内出现炎症后，带有炎症因子的分泌物长期刺激鼻咽黏膜会引起慢性鼻咽炎;另外，长时间处于干燥环境中吸入粉尘会损伤鼻黏膜纤毛功能，也会使鼻咽部黏膜出现炎症反应。
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