胃肠道间质瘤主要是由于基因突变引起的，环境因素、遗传因素等原因可诱发胃肠道间质瘤。
一、基本病因
患者体内的酪氨酸激酶血小板源性生长因子受体α等基因存在突变的情况时，可刺激肿瘤细胞的持续生长，从而导致患者出现胃肠道间质瘤的情况。
二、诱发因素
1、环境因素
患者长期处于存在放射线的环境中时，放射线对其体内的细胞产生刺激，造成其体内的致癌因子减少，进一步诱发胃肠道间质瘤的形成。
2、遗传因素
患者有亲属患有神经纤维瘤病1型、Carney-Stratakis综合征等疾病时，可造成其患胃肠道间质瘤的风险增加。
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